鲸鱼威利回到了属于自己的家园,而杰西(杰森·詹姆斯·里希特 Jason James Richter 饰)亦已经长大,成为了一名海岸科考队队员,可是,他们之间的故事并没有完结。男孩麦克斯(Vincent Berry 饰)的父亲约翰(帕特里克·基尔帕特里克 Patrick Kilpatrick 饰)是一名非法捕鲸手,有时候,当他穿梭在惊涛骇浪之中追随着鲸鱼的身影之时,会将麦克斯带在身边,这令麦克斯对鲸鱼的感情十分矛盾。
一次捕鲸行动中,麦克斯和父亲闯入了威利的领地,处境十分危急,在生死攸关的紧要关头,杰西出现化解了危机。这场意外令麦克斯逐渐了解了父亲所作所为带来的危害,可是约翰依旧我行我素。又一次,约翰在行动中落入海中生死垂危,威利不计前嫌挺身而出,救下了约翰。